فسفریلاسیون اکسیداتیو فرایند پیچیده ای است که برای سنتز مولکول ATP به کار میرود. این فرایند از تعداد زیادی واکنش شیمیایی تشکیل شده است. در مدلسازی زیر این واکنشها به طور نمادین نشان داده شده اند.